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氟康唑膠囊主要用于以下適應癥中病情較重的患者：

1.念珠菌病：用于治療口咽部和食道念珠菌感染;播散性念珠菌病，包括腹膜炎、肺炎、尿路感染等;念珠菌外陰陰道炎。尚可用于骨髓移植患者接受細胞毒類藥物或放射治療時，預防念珠菌感染的發生。

2.隱球菌病：用于治療腦膜以外的新型隱球菌病;治療隱球菌腦膜炎時，氟康唑膠囊可作為兩性霉素B聯合氟胞嘧啶初治后的維持治療藥物。

3.球孢子菌病。

4.用于接受化療、放療和免疫抑制治療患者的預防治療。

5.氟康唑膠囊亦可替代伊曲康唑用于芽生菌病和組織胞漿菌病的治療。

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