一般來說，每個績效審計項目大致要經過四個步驟：
    （一）初步調查
     績效審計的對象是各種不同性質的投資、規劃和管理活動。所以，績效審計必須圍繞著投資、規劃、管理項目的實施單位進行一系列的具體審計工作。在初步調查中，審計人員的工作就是從收集項目實施單位的基本情況和總況資料開始。根據這些初步調查的資料，首先確定該項目應該達到的目標或目標的適當水平，并鑒定投資、規劃項目的可行性方案。然后，編制一份在選定的領域里(審計范圍)的管理監督系統的審查提綱。
    (二)監督管理系統的審查
    審計人員通過對管理監督系統的審查，來測試與審計項目相關的項目實施單位管理監督系統的健全和有效性，并取得相關的證據。以確定完成項目目標的標準是否是公認的并是否被接受和執行，項目完成后的結果如何，  以及這些結果是否可全部作為我們的審計目標。然后，審計人員要編制一份詳細審計方案。
    上述兩個步驟，在實際審計工作中通常作為一個步驟來實施。
    我們在實施“農業高科技示范園”績效審計項目時，首先對被審計單位的基本情況和立項文件進行了初步調查，再對項目的監督管理系統進行審查，確定審計評價標準和初步審計目標。
    當前，我們搞績效審計，在審計標準確定方面，面臨著兩大難點：一是投資規劃項目的立項文件中各項規劃投資目標的鑒定；二是沒有公認的評價標準體系，審計標準難以確定。我們在對“農業高科技示范園”績效審計的過程中，首先從觀念上轉變得比較徹底，認為：只有經過實踐，才能探索經驗；只有經過調查，才能獲得標準和結論。在對投資規劃項目立項文件中的各項投資目標鑒定上，客觀得分析了立項文件目標的各項指標、項目實施過程和結果，采取詢訪、咨詢和做大量社會調查的方法，得出比較客觀和社會公認的項目目標評價標準。在確定社會效益評價標準時，對市蔬菜辦公室等6部門、蔬菜批發市場、鎮政府分管農業的領導、14個蔬菜種植專業戶、2個蔬菜出口加工企業及多名蔬菜專業技術人員，從不同角度進行了40多人次深入細致的詢訪、調查工作，得出了比較客觀的審計標準和初步結論，確定了“項目實施及管理情況，產生的社會效益與經濟效益情況，  以評價社會效益為主”的初步審計目標。
    (三)詳細檢查
    審計人員按照審計目標收集足夠的相關、重要、充分的證據，以審查項目執行者是否按照項目規劃的目標來實施項目的，  以及是否達到了預期結果，如果沒有完成，要分析沒有完成的原因，并要認真總結項目實施結果好的經驗和做法。然后，審計人員總結和分析全部證據，并得出審計目標的相應結論。
    我們在實施“農業高科技示范園”績效審計項目時，根據審計目標，編制了詳細審查提綱。
    我們分析了可能影響項目實施結果的原因，確定將下列人員和單位作為我們的詢訪、調查、咨詢范圍：(1)政府官員，了解決策意圖；(2)．項目執行單位有關管理人員，了解是否按立項規劃目標和有關管理要求實施項目；(3)有關技術人員， 了解項目是否起到示范作用，保持了技術領先的地位；(4)承包者，了解是否按照項目管理者的要求，進行新技術實驗和種植；(5)農戶，了解對示范園的“示范”作用的認識，對發展高效農業和推廣農業新技術前景評估，種植大棚蔬菜與傳統農業的比較效益；(6)蔬菜加工企業，了解所需蔬菜品種、進貨價格、數量及渠道，本地蔬菜的供應量及占所需數量的比重，消化本地蔬菜的能力等； (7)蔬菜市場及市場管理人員，考察市場供應量及需要量，進貨渠道，了解市場對反季蔬菜和新品種的需求情況，市場管理對蔬菜上市的要求等。
    上述所舉七方面的原因，是我們詳細審查工作的基礎，按此思路，我們對項目實施及管理情況、社會效益和經濟效益情況制定了詳細審計提綱，并建立各分項審計目標。如：在項目實施及管理方面，確定對項目立項情況、是否按規劃目標及有關管理要求實施、實施過程中是否存在損失浪費現象、是否積極推廣新技術和新品種、  自身經濟效益是否達到規劃目標、項目資金的到位和使用情況等幾個問題，進行詳細審查；在社會效益方面，確定對高效農業種植技術的推廣及應用情況、農戶的認識及與傳統農業的效益比較、引進和推廣新品種情況、探索試驗新技術情況、市場本地蔬菜供應情況、蔬菜加工企業對本地蔬菜的需求情況等問題，進行詳細審查；在項目自身經濟效益方面，確定對項目總體投資收益、項目設施建設成本、示范園種植收益、設施及設備利用率、土地利用率等問題，進行詳細審查。
    (四)編寫和提出審計報告
    在詳細審查的基礎上，審計組要根據足夠的證據提出審計結論，進行綜合分析，歸納提出加強和改進管理的建議，編寫一份績效審計報告。向投資管理者或委托者以及被審計單位提交績效審計報告，  以便對審計結果和建議的認可和采納。
    關于績效審計的方法，我們是根據所要完成的審計項目及特點而采用幾種方法。
    績效審計所關注的是經濟性、效率性和效益性，所以它不僅僅局限于檢查會計資料和有關文件。如前所述，在進行績效審計時，審計人員要接觸與審計事項有關的人員，考察現場，還要對有關事實進行詢訪、調查及咨詢。
    績效審計是建設性的、幫助性的。是我們審計機關為政府公共支出決策和管理單位提供信息、咨詢服務的審計行為，是強化我們審計機關服務功能的具體體現。
    績效審計強調分析的客觀性。它不搞先入為主的結論，也不批評任何人和單位。
    進行績效審計時，應該盡量地檢查那些取得成功的地方及未能達到預期績效的地方。要做好經驗總結和缺陷分析的工作。
我們在確定“農業高科技示范園”績效審計項目后，與被審計單位主管部門溝通時，該主管部門就是認為我們審計機關是專門挑毛病的，盡管我們把此項審計的目的講得很明白，但他們就是不理解，最后是無可奈何地接受了審計。審計項目結束后，我們將審計報告送交他們征求意見時，他們對審計結論、建議，對我們所做的大量社會調查結果，都表示出滿意的態度，并一再強調這個項目審晚了，對報告中所做結論和建議，表示接受并立即采取措施加以改進。

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